Investigació
Eines
© Antoni Costa
centro balear de biodiversidad
En aquesta pàgina podeu accedir a una llista exhaustiva d’enllaços relacionats amb el camp de la biologia.
Aquest llistat es desenvolupa contínuament. Si teniu algun enllaç que us agradaria afegir-hi o en trobau algun que no funciona, no dubteu a contactar amb nosaltres!
Biodiversitat
| Web | Descripció |
| AlgaeBase | Base de dades global d’algues que proporciona informació taxonòmica, nomenclatural i de distribució. |
| Bioatles | Mapa de biodiversitat de les Illes Balears. |
| Biodibal | Bases de dades locals que contenen registres d’espècies de les Illes Balears. |
| Biodiversity Information Standards (TDWG) | Organització sense ànim de lucre i una comunitat dedicada al desenvolupament d’estàndards d’informació sobre biodiversitat. |
| Catalogue of Life | Base de dades global que conté una llista fiable d’espècies. És mantinguda per centenars de taxònoms globals. |
| Encyclopedia of Life (EOL) | Accés global al coneixement sobre la vida a la Terra. |
| Ephemeroptera of the world | Base de dades global que inclou noms vàlids, sinònims, dades bibliogràfiques, dades d’exemplars, imatges, sons i distribució d’efemeròpters de tot el món. |
| Euro+Med PlantBase | Base de dades europea que cobreix totes les plantes vasculars natives i introduïdes d’Europa, el Mediterrani i el Caucas. |
| Fauna Europea | Base de dades europea fiable que conté noms científics i distribucions de totes les espècies animals terrestres i d’aigua dolça multicel·lulars conegudes actualment a Europa. |
| Fishbase | Base de dades global de peixos que proporciona informació taxonòmica, nomenclatural i de distribució. |
| freshwaterecology.info | Base de dades europea que conté característiques autecològiques, preferències ecològiques i trets biològics, així com patrons de distribució de més de 20.000 organismes d’aigua dolça europeus pertanyents a peixos, macroinvertebrats, macròfits, fitobentos i fitoplàncton. |
| Global Biodiversity Information Facility (GBIF) | Base de dades global que conté accés gratuït i obert a dades de biodiversitat. |
| Integrated Taxonomic Information System (ITIS) | Base de dades global que conté informació taxonòmica fiable sobre plantes, animals, fongs i microbis. |
| Ocean Biodiversity Information System (OBIS) | Base de dades global que conté dades d’accés obert i informació sobre biodiversitat marina. |
| Ortoptera of the world | Base de dades global que inclou noms vàlids, sinònims, dades bibliogràfiques, dades d’exemplars, imatges, sons i distribució d’ortòpters del món. |
| Plecoptera of the world | Base de dades global que inclou noms vàlids, sinònims, dades bibliogràfiques, dades d’exemplars, imatges, sons i distribució de plecòpters de tot el món. |
| Species 2000 | Base de dades global que conté informació taxonòmica que involucra taxònoms de tot el món. |
| Taxo&Map | Eina de visualització que proporciona accés a dades taxonòmiques i de distribució geogràfica de diferents espècies i grups taxonòmics. Permet explorar i analitzar informació sobre la diversitat biològica. |
| World Odonata list | Llistat global dels Odonata del món. |
| World Register of Marine Species (WoRMS) | Base de dades global que conté una classificació i taxonomia fiable principalment d’espècies marines. |
Genética
| Web | Descripció |
| Barcode of Life Data System (BOLD) | Plataforma que combina eines d’emmagatzematge i anàlisi de dades desenvolupades per al metabarcoding. |
| EMBL’s European Bioinformatics Institute | L’Institut Europeu de Bioinformàtica (EMBL-EBI) de l’EMBL manté la gamma més completa de recursos de dades moleculars disponibles de forma gratuïta i actualitzada al món. |
| European Nucleotide Archive (ENA) | Base de dades europea que proporciona un registre complet de la informació de seqüenciació de nucleòtids del món, que abasta dades de seqüenciació en brut, informació d’assemblatge de seqüències i anotació funcional. |
| Hight quality ribosomal RNA database (SILVA) | Base de dades global que proporciona conjunts de dades exhaustius, verificats i actualitzats regularment de seqüències d’ARN ribosomal (rRNA) alineades de subunitats petites (16S/18S, SSU) i grans (23S/28S, LSU) per als tres dominis de la vida (Bacteris, Arquèes i Eucariotes). |
| National center for Biothecnology Information(NCBI) | Base de dades global que inclou informació biomèdica i genòmica. |
Paquete R
| Web | Descripció |
| ape | Paquet útil per a realitzar anàlisis filogenètics. |
| BAT | Paquet útil que inclou algoritmes per avaluar la diversitat alfa i beta en totes les seves dimensions (taxonòmica, filogenètica i funcional). |
| biomod2 | Paquet que conté funcions per modelar la distribució d’espècies, calibratge i avaluació, muntatge de models, pronòstic de muntatge i visualització. |
| biomonitoR | Paquet útil per a gestionar dades ecològiques i calcular índexs de biomonitorització. |
| dplyr | Paquet que proporciona un conjunt de funcions que t’ajuden a resoldre les manipulacions de dades més comunes. |
| envirem | Paquet de R útil per crear variables ambientals útils per a la recerca ecològica. |
| hypervolume | Paquet útil per a estimar la forma i el volum de conjunts de dades d’alta dimensionalitat. |
| raster | Paquet útil per llegir, escriure, manipular, analitzar i modelar dades espacials. |
| rentrez | Interfície de R per cercar en bases de dades de diversos bancs genètics. |
| rgbif | Interfície programàtica als mètodes de serveis web proporcionats per la Global Biodiversity Information Facility. |
| rredlist | Paquet de R útil per utilitzar les API de la IUCN. |
| sf | Paquet útil per treballar amb dades espacials. |
| terra | Paquet útil per a la gestió de l’anàlisi de dades espacials amb dades vectorials (punts, línies, polígons) i dades ràster (gràfics). |
| vegan | Paquet útil per a mètodes d’ordenació, anàlisi de diversitat i altres funcions per a ecòlegs. |
| wdpar | Interfície per accedir al repositori de les àrees protegides a nivell mundial. |
Capas espaciales
| Web | Descripció |
| Agencia Estatal de Meteorologia (AEMET) | Capes de cartografia de l’AEMET. |
| Blue Habitats | Dades geomòrfiques del fons marí global. |
| British Oceanographic Data Center (BODC) | Dades marines diverses. |
| Chelsa | Dades climàtiques globals de alta resolució. |
| Copernicus Global Land Service | Temperatura global de la superfície terrestre. |
| Copernicus Marine Data | Dades marines diverses (sèries temporals i dades de teledetecció). |
| Corine | Cobertura terrestre Corine d’Europa. |
| Eurostat – Geographical information and maps | Conjunt de dades d’unitats estadístiques que representa la nomenclatura europea d’unitats territorials. |
| Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO) | Dades espacials diverses. |
| GADM | Conjunt de dades global que proporciona mapes i dades espacials per a tots els països i les seves subdivisions. |
| General Bathymetric Chart of the Oceans (GEBCO) | Conjunts de dades de batimetria global per als oceans. |
| Global Climate Monitor | Visor web de dades climàtiques mundials. |
| Global Sea Level Observing System (GLOSS) | Dades globals de nivell del mar. |
| HydroSHEDS database | Capes de dades digitals globals en suport de la recerca hidroecològica. |
| IdeIB | Infraestructura de Dades Espacials de les Illes Balears. |
| LP DACC | Dades espacials diverses. |
| Ministerio para la transicion ecologica (MITECO) | Capes de cartografia del MITECO (biodiversitat). |
| Ministerio para la transicion ecologica (MITECO) | Capes de cartografia del MITECO (paisatge). |
| Ministerio para la transicion ecologica (MITECO) | Capes de cartografia del MITECO (biodiversitat – espècies terrestres). |
| Ministerio para la transicion ecologica (MITECO) | Capes de cartografia del MITECO (biodiversitat – Bases ecològiques preliminars per a la conservació de les espècies d’interès comunitari a Espanya: Invertebrats). |
| Ministerio para la transicion ecologica (MITECO) | Capes de cartografia del MITECO (biodiversitat – Àrees protegides). |
| Ministerio para la transicion ecologica (MITECO) | Capes de cartografia del MITECO (zones humides). |
| Ministerio para la transicion ecologica (MITECO) | Capes de cartografia del MITECO (boscos). |
| Ministerio para la transicion ecologica (MITECO) | Capes de cartografia del MITECO (parcs nacionals). |
| Ministerio para la transicion ecologica (MITECO) | Capes de cartografia del MITECO (regions biogeogràfiques). |
| Ministerio para la transicion ecologica (MITECO) | Capes de cartografia del MITECO (regions fitoclimàtiques). |
| Ministerio para la transicion ecologica (MITECO) | Miscel·lània de capes de cartografia. |
| Ministerio para la transicion ecologica (MITECO) – Infraestructura de Datos Espaciales de España | Miscel·lània de capes de cartografia. |
| NASA’s Ocean Biology Processing Group (OBPG) | Dades i programari per a l’anàlisi espacial. |
| National centers of Environmental Information (NOAA-NCEI) | Dades espacials diverses. |
| National Snow and Ice Data Center | Dades globals sobre neu, gel, glacials i sòls congelats. |
| Natura 2000 data | Capes del programa europeu Natura 2000. |
| One Geology | Mapa geològic del món. |
| Physical Oceanography Distributed Active Archive Center (PO DAAC) | Dades oceàniques i climàtiques de la NASA. |
| Portal de l’aigua de les Illes Balears | Plataforma en línia que proporciona accés a dades, estudis, informació i recursos relacionats amb els recursos hídrics de les Illes Balears. |
| SOCIB | Infraestructura científica i tecnològica que proporciona fluxes de dades oceonogràfiques obertes i gratuïtes. |
| Soil grids – viewer | Base de dades global que emmagatzema un sistema basat en dades que prediu les propietats i classes del sòl utilitzant covariables globals i models ajustats a nivell mundial (visor). |
| World Coastlines | Línia de costa mundial (Princeton University). |
| World map of the Köppen-Geiger climate classification | Mapa climàtic de Köppen-Geiger. |
| WorldClim | Dades climàtiques globals útils per a la modelització ecològica. |
La nostra plataforma de biodiversitat
És un sistema informàtic públic avançat dissenyat per recopilar, gestionar, analitzar i compartir dades sobre la biodiversitat de les Illes Balears.
El nostre repositori a GitHub
Les nostres eines creades per al maneig i anàlisi de dades ecològiques i bioinformàtiques estan disponibles en obert
