Categoria: Cursos

Categories
Cursos

Introducció a l’ADN ambiental i metabarcoding CAT

Del 25 al 27 de novembre de 2025

Introducció a l’ADN ambiental i metabarcoding de comunitats d’eucariotes

Aquest curs ofereix una introducció general als mètodes moleculars d’anàlisi de la biodiversitat a partir de l’ADN extret de mostres ambientals, dels procediments d’anàlisi de metabarcoding (laboratori i estratègies de seqüenciació) i dels mètodes bioinformàtics de tractament de dades i d’assignació taxonòmica utilitzant bases de dades de referència. El curs posa èmfasi en la resolució pràctica de problemes i el treball aplicat, utilitzant exemples basats en conjunts de dades reals. És un curs introductori, apte per a participants sense experiència prèvia en metabarcoding.

Adreçat a: Personal tècnic, estudiants de grau, investigadors i professorat interessats a aplicar eines moleculars a l’estudi de la biodiversitat. Es valorarà tenir nocions bàsiques de programació i gestió de dades.

Requisits: Adjuntar una carta de motivació especificant les raons per participar-hi i la relació amb la trajectòria acadèmica o professional.

tEACHERS

Owen S. Wangensteen (Universidad de Barcelona)

Adrià Antich (Centre d’Estudis Avançats de Blanes, CEAB-CSIC)

QUAN I ON

25/11/2025 al 27/11/2025
25–26/11: 9:00 h a 17:00 h
27/11: 9:00 h a 16:00 h
ParcBit, edifici Complex I+D

Gratuït amb inscripció prèvia

(Enllaç disponible aviat al portal FUEIB)

Categories
Cursos

Anàlisi de Dades RADseq CAT

Del 29 de setembre al 2 d’octubre de 2025

Anàlisi de Dades RADseq

Curs centrat en l’anàlisi de dades de seqüenciació genòmica associada a punts de restricció (RADseq) per identificar i genotipar polimorfismes d’un sol nucleòtid (SNP), una tècnica clau per al genotipat d’organismes no model. Aquestes metodologies permeten detectar milers de variants genètiques en centenars d’individus de manera ràpida i econòmica.

S’hi abordaran diferents mètodes per a l’obtenció i anàlisi d’aquestes dades, amb un èmfasi especial en l’anàlisi bioinformàtica mitjançant el programari Stacks. El curs inclourà també una introducció a conceptes fonamentals i avançats d’Unix.

Adreçat a: Personal tècnic, estudiants de postgrau i investigadors interessats en l’anàlisi de dades de seqüenciació genòmica de representació reduïda (RRGS), com ara RAD-seq, ddRAD, 2bRAD, GBS, aplicats principalment a organismes no model, amb o sense genoma de referència.

Requisits: Coneixements bàsics de biologia i familiaritat amb dades genòmiques derivades de tecnologies de seqüenciació massiva (NGS). Es recomana tenir nocions de programació.

Docents:

Natalia Díaz Arce (AZTI)

Naiara Rodríguez-Ezpeleta (AZTI)

QUAN I ON

29/09/2025 al 02/10/2025
9:00 h a 16:00 h (1 hora per dinar)
ParcBit, edifici Complex I+D

Gratuït amb inscripció prèvia

Inscripcions
Categories
Cursos

Curso en Medición de la Diversidad Biológica: Herramientas y Limitaciones cat

Del 21 al 24 de gener de 2025

Curs de mesurament de la diversitat biològica: eines i limitacions

El mesurament de la diversitat biològica és fonamental en els estudis ecològics, la conservació de les espècies i el seguiment dels canvis ambientals. En l’actualitat, la recerca en aquest camp ha avançat considerablement i s’han desenvolupat mètodes més precisos i complexos per avaluar la diversitat a diferents nivells, des dels gens fins als ecosistemes. Aquests mètodes inclouen tant mètriques tradicionals, com la riquesa d’espècies, com eines més avançades que integren dimensions funcionals i filogenètiques, que proporcionen una visió més completa i matisada de la biodiversitat. Tanmateix, la tria del mètode adequat depèn de múltiples factors, com el tipus d’ecosistema, els objectius específics de la recerca i els recursos disponibles. En aquest context, comprendre i qüestionar críticament les limitacions, biaixos i supòsits de cada metodologia és cada vegada més rellevant per millorar la precisió i utilitat de les dades obtingudes i contribuir a una ciència de la biodiversitat més sòlida i fiable.

Personal docent

Joaquín Hortal (MNCN)

Quan i on

21/01/2025 al 24/01/2025

9:30h a 16:30h

Edifici complex M2 (Carrer Blaise Pascal, 7, Parc Bit)

Inscripciones

Descargar folleto

cloud_download
Categories
Cursos

Curso de análisis de diversidad funcional en R Cat

Del 4 al 7 de novembre de 2024

Curs d’anàlisi de diversitat funcional en R

En les dues darreres dècades les anàlisis de la diversitat funcional (DF) en ecologia han augmentat de manera exponencial, la qual cosa ha permès ampliar els nostres coneixements de la diversitat biològica i la seva evolució al llarg de l’espai i el temps. La pràctica totalitat de subdisciplines de l’ecologia reconeixen el gran valor afegit que aporta l’anàlisi funcional d’espècies i comunitats. Això ha donat peu a la proliferació de mètodes d’estimació de dimensions contrastades de la DF. Tanmateix, les diferencies entre aquests mètodes i la seva aplicació han generat incoherències terminològiques i confusió a l’hora de seleccionar l’enfocament més idoni per abordar qüestions específiques en el camp de l’ecologia. En aquest curs aprofundirem en les bones i males pràctiques de les anàlisis de DF, amb especial èmfasi en el paquet BAT en R (una eina per a l’avaluació de la biodiversitat).

Personal docent

Stefano Mammola (Italian National Research Council, Institute of Water)

Quan i on

04/11/2024 al 07/11/2024

9:30h a 16:30h

Edifici complex M2 (Carrer Blaise Pascal, 7, Parc Bit)

Inscripciones

Descargar folleto

cloud_download
Categories
Cursos

Curso de modelos de distribución de especies en R Cat

Del 24 al 27 de setembre de 2024

Curs de models de distribució d’espècies en R

Aquest curs està destinat a estudiants, investigadors/es i persones interessades a crear mapes per entendre com el canvi climàtic podria afectar la distribució de les seves espècies d’estudi. Hi aprendrem a descarregar dades d’ocurrència d’espècies en repositoris en línia de biodiversitat (com GBIF), a descarregar i visualitzar mapes amb variables climàtiques en format GIS, i a programar i entendre quins tipus d’algoritmes existeixen per a la modelització de nínxols ecològics (ENM) en R.

Personal docent

Sara Varela González (Universidad de Vigo)

Sofía Galván Arcones (Universidad de Vigo)

Quan i on

24/09/2024 to 27/09/2024

9h a 15h

Edifici complex M2 (Carrer Blaise Pascal, 7, Parc Bit)

Inscripciones

Descargar folleto

cloud_download
Categories
Cursos

Curso de introducción a la teoría de la genética de poblaciones y el análisis de datos RAD-seq Cat

Del 2 al 6 de setembre de 2024

Curs d’introducció a la teoria de la genètica de poblacions i l’anàlisi de dades RAD-seq

En aquest curs, els participants aprendran els fonaments de la teoria de la genètica de poblacions i com aplicar-la per fer inferències sobre els processos poblacionals i la història de les espècies. Estudiarem com canvien els patrons de diversitat genètica al llarg del temps i els processos subjacents a aquests canvis. A més, analitzarem els processos microevolutius i el seu impacte en la diversitat de les espècies, així com la manera de conèixer la història de les espècies. L’objectiu és comprendre com els processos evolutius generen patrons i canvis que afecten la diversitat biològica al llarg del temps i de l’espai. El segon mòdul del curs explorarà un dels principals mètodes per investigar la diversitat genètica en poblacions amb disponibilitat limitada o nul·la de genomes de referència: RAD-seq (seqüenciació d’ADN associada a llocs de restricció). En aquest curs de tres dies, els participants aprendran a generar i analitzar dades RAD-seq i a aplicar mètodes comuns de genètica de poblacions.

Personal docent

Narjes Yousefi (University of Zurich)

Hans Kristen Stenøien (Norwegian University of Science and Technology)

QUAN I ON

02/09/2024 a 06/09/2024

9h a 16h

Edifici complex M2 (Carrer Blaise Pascal, 7, Parc Bit)

Inscripciones

Descargar folleto

cloud_download
Categories
Cursos

Curso de introducción al análisis de biodiversidad en R Cat

Del 17 al 19 de juny de 2024

Curs d’introducció a l’anàlisi de biodiversitat en R

La riquesa i diversitat d’espècies exhibeixen una variabilitat temporal i espacial influenciada per factors ambientals i històrics. Aquest curs aspira que els participants es familiaritzin amb metodologies fonamentals aplicables en el llenguatge de programació R per a la recerca de la biodiversitat. Després d’una breu recapitulació del curs introductori anterior sobre R, els objectius principals són: (1) dilucidar models estadístics comuns pertinents per a les investigacions de biodiversitat, incloent-hi els seus supòsits subjacents i la seva aplicació pràctica, i (2) aprendre l’ús de dades basades en ADN (per exemple, filogènies) per abordar qüestions rellevants dins de la investigació de la biodiversitat.

Personal docent

Diego Fontaneto (CNR)

Quan i on

17/06/2024 a 19/06/2024

10h a 17h

Edifici complex M2 (Carrer Blaise Pascal, 7, Parc Bit)

Inscripciones

Descargar folleto

cloud_download
Categories
Cursos

Curso de ensamblaje y preparación de genomas de referencia para el Earth Biogenome Project Cat

Del 6 al 9 de maig de 2024

Curs d’assemblatge i preparació de genomes de referència per a l’Earth Biogenome Project

L’Earth Biogenome Project (EBP) aspira a seqüenciar, assemblar, catalogar i caracteritzar el genoma de totes les espècies d’eucariotes a la Terra. Això és possible gràcies a avenços substancials que han tengut lloc en els darrers anys, tant en el camp de les tecnologies de seqüenciació com en el dels recursos i eines bioinformàtiques. Els assemblatges de genomes generats com a part de l’EBP han de complir certs estàndards de qualitat per assegurar-ne la contigüitat, precisió, que estiguin sencers i que hi hagi representació cromosòmica. En aquest curs de 4 dies ens centrarem en com s’han d’obtenir assemblatges de gran qualitat a nivell cromosòmic, i mostrarem com es produeix assemblatge de genomes amb fragments llargs i dades Hi-C. Cobrirem totes les passes necessàries per produir i avaluar un assemblatge de genoma, i posarem especial atenció a la passa de tractament manual.

Personal docent

Tyler Alioto (CNAG)

Jèssica Gómez-Garrido (CNAG)

Asistencia de Karen Schöninger (CBB-UIB)

Quan i on

06/05/2024 al 09/05/2024

10h a 17h

Edifici complex M2 (Carrer Blaise Pascal, 7, Parc Bit)

Inscripciones

Descargar folleto

cloud_download
Categories
Cursos

Curso de introducción a la secuenciación con Nanopore: fundamentos y análisis Cat

Del 15 al 17 d’abril de 2024

Curs d’introducció a la seqüenciació amb Nanopore: fonaments i anàlisi

En aquest curs oferirem una visió general de la seqüenciació amb Nanopore, amb èmfasi en l’aplicació d’aquesta tecnologia a l’estudi d’assemblatge de genomes, seqüenciació de zones concretes amb enriquiment en laboratori i informàtic, estudis d’amplicons i obrirem altres possibilitats com seqüenciació directa d’ARN o detecció de canvis epigenètics. El curs inclou xerrades teòriques, demostracions de laboratori de la preparació de llibreries i càrrega de les flow cells per a seqüenciació, així com les diverses eines bioinformàtiques per a la utilització de les dades generades per Nanopore.

Personal docent

Dr. Ramón Gallego Simón (UAM)

Ana Isabel Ramón-Laca (MNCN – CSIC)

Asistencia de Lluís Moragues y Laura Triginer (CBB-UIB)

Quan i on

15/04/2024 a 17/04/2024

9:30h a 13:30h

Edifici Antoni Maria Alcover UIB

Inscripciones

Descargar folleto

cloud_download

Categories
Cursos

Curso de introducción a la filogenia Cat

Del 8 a l’11 d’abril de 2024

Curs d’introducció a la filogènia

Aquest curs introductori a la filogènia està concebut per dotar els assistents d’una base sòlida en els conceptes essencials de la filogenètica i proporcionar-los les eines necessàries per analitzar de manera autònoma les relacions evolutives entre organismes. Al llarg del curs, els participants coneixeran els tipus de dades emprades en estudis filogenètics, l’estructura i el maneig dels diversos formats d’arxiu, així com els principals mètodes d’alineament de seqüències. S’exploraran diversos models evolutius que fonamenten els mètodes d’inferència d’arbres filogenètics, entre els quals s’inclouen la màxima parsimònia, la màxima versemblança i els mètodes bayesians.

Personal docent

Dr. José Antonio Jurado Rivera (UIB)

Dr. Joan Pons Pons (IMEDEA, CSIC-UIB)

Quan i on

08/04/2024 a 11/04/2024

9h a 17h

Edifici Antoni Maria Alcover UIB

Inscripciones

Descargar folleto

cloud_download